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Scatterplot con valores faltantes

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  • Si mejoran el codigo, colocar en una respuesta para yo tambien tomar el codigo y mejorar mis funciones, si pueden tambien documenten aun mejor las funciones de la manera mas clara y concisa para que sea mas entendible lo que hacen.
  • Para ejecutar el en cuaderno jupyter
(
    riskfactors_df
    .missing.missing_scatterplot_with_dummies(
        columns_NA1='weight_lbs_NA',
        columns_NA2='height_inch_NA',
        x='weight_lbs',
        y='height_inch'
    )
)

Colocar esto en el area del archivo para extender las funciones:

 #metodo para obtener relleno de columna con dummies, para usar en funcion de scatterplot
    def column_fill_with_dummies(
        self,
        column: pd.Series,
        proportion_below: float=0.10,
        jitter: float=0.075,
        seed: int=42
    ) -> pd.Series:
        
        column = column.copy(deep=True)

        # Extract values metadata.
        missing_mask = column.isna()
        number_missing_values = missing_mask.sum()
        column_range = column.max() - column.min()

        # Shift data
        column_shift = column.min() - column.min() * proportion_below

        # Create the "jitter" (noise) to be added around the points.
        np.random.seed(seed)
        column_jitter = (np.random.rand(number_missing_values) - 2) * column_range * jitter

        # Save new dummy data.
        column[missing_mask] = column_shift + column_jitter

        return column

Y la parte importante:

    #metodo para visualizar valores NA y !NA desde una tabla a la que se relleno con dummies
    def missing_scatterplot_with_dummies(
        self,
        columns_NA1,
        columns_NA2,
        x,
        y
    ):
        return (
            self._obj
            .select_dtypes(
                exclude="category"
            )
            .pipe(
                lambda df: df[df.columns[df.isna().any()]]
            )
            .missing.bind_shadow_matrix(true_string=True, false_string=False)
            .apply(
                lambda column: column if "_NA" in column.name else self.column_fill_with_dummies(column, proportion_below=0.05, jitter=0.075)
            )
            .assign(
                nullity=lambda df: df[columns_NA1] | df[columns_NA2]
            )
            .pipe(
            lambda df: (
                sns.scatterplot(
                    data=df,
                    x=x,
                    y=y,
                    hue="nullity"
                    )
                )
            )
        )

Para el reto mi c贸digo que utilice en el archivo 鈥渓ive-exploration-missing-values.ipynb鈥 fue el siguiente:

(
    riskfactors_df
    .missing
    .scatterplot_valores_faltantes(
            columna_1="weight_lbs",
            columna_2="height_inch"
    )
)

Resultado:

Y el c贸digo que agregu茅 al archivo 鈥減andas-missing-extension.ipynb鈥 fue el siguiente:

    def column_fill_with_dummies(
        self,
        column: pd.Series,
        proportion_below: float=0.10,
        jitter: float=0.075,
        seed: int=42
        ) -> pd.Series:

        column = column.copy(deep=True)

        # Extract values metadata.
        missing_mask = column.isna()
        number_missing_values = missing_mask.sum()
        column_range = column.max() - column.min()

        # Shift data
        column_shift = column.min() - column.min() * proportion_below

        # Create the "jitter" (noise) to be added around the points.
        np.random.seed(seed)
        column_jitter = (np.random.rand(number_missing_values) - 2) * column_range * jitter

        # Save new dummy data.
        column[missing_mask] = column_shift + column_jitter

        return column
        
    def scatterplot_valores_faltantes(self, columna_1: str, columna_2: str) -> pd.DataFrame:
        columna_NA_1 = columna_1 + "_NA"
        columna_NA_2 = columna_2 + "_NA"

        plt.figure(figsize=(10, 10))
        (
            self._obj
            .select_dtypes(exclude="category")
            .pipe(lambda df: df[df.columns[df.isna().any()]])
            .missing.bind_shadow_matrix(true_string=True, false_string=False)
            .apply(
                lambda column: column if "_NA" in column.name 
                else self._obj.missing.column_fill_with_dummies(column, proportion_below=0.05, jitter=0.075)
            )
            .assign(nullity=lambda df: df[columna_NA_1] | df[columna_NA_2])
            .pipe(
                lambda df: (
                    sns.scatterplot(
                        data=df, x=df[columna_1], y=df[columna_2], hue="nullity"
                    )
                )
            )
        )

Codigo de la grafica de dos variables con valores faltantes

(
    riskfactors_df
    .select_dtypes(
        exclude='category'  # excluye las variables categoricas
    )
    .pipe(
        lambda df: df[df.columns[df.isna().any()]] #seleccionar solo columnas que tengan valores faltantes
    )
    .missing.bind_shadow_matrix(true_string = True, false_string = False)
    .apply(
        lambda column: column if '_NA' in column.name else column_fill_with_dummies(column, proportion_below=0.05, jitter=0.075)
    )
    .assign(
        nullity = lambda df: df.weight_lbs_NA | df.height_inch_NA
    )
    .pipe(
        lambda df: (
            sns.scatterplot(
                data = df,
                x='weight_lbs',
                y= 'height_inch',
                hue='nullity'
            )
        )
    )
)

Pasar el c贸digo realizado durante la clase a las funciones del archivo 鈥減andas-missing-extension.ipynb鈥.

Codigo de pandas-missing-extension.ipynb

def column_fill_with_dummies(
        column:pd.Series,
        proportion_below: float=0.10,
        jitter: float=0.07,
        seed: int=42
    ) -> pd.Series:

        column = column.copy(deep= True)

        #Extract values metada
        missing_maks = column.isna()
        number_missing_values = missing_maks.sum()
        column_range = column.max() - column.min()

        #Shift data
        columns_shift = column.min() - column.min() * proportion_below

        #Create the "jitter" (noise) to be added around the point
        np.random.seed(seed)
        column_jitter = (np.random.rand(number_missing_values) - 2) * column_range * jitter

        #Save new dummy data
        column[missing_maks] = columns_shift + column_jitter

        return column

    def variable_null_values(self, var1, var2):
        (
            self._obj.select_dtypes(
                exclude='category'
            )
            .pipe(
                lambda df: df[df.columns[df.isna().any()]]
            )
            .missing.bind_shadow_matrix(true_string=True, false_string=False)
            .apply(
                lambda column: column if "_NA" in column.name else column_fill_with_dummies(column, proportion_below=0.05, jitter=0.075)
            )
            .assign(
                nullity = lambda df: df[var1+'_NA'] | df[var2+'_NA']
            )
            .pipe(
                lambda df: (
                    sns.scatterplot(
                        data = df,
                        x=var1,
                        y=var2,
                        hue='nullity'
                    )
                )
            )
        )

Ejecutar c贸digo en nuestro notebook de trabajo llamando a la funci贸n

riskfactors_df.missing.variable_null_values('weight_lbs', 'height_inch')

Yo lo hice asi

    def scatter_dummies(self, columns: list[str]):
        """Recibes a list of two strings with the name of the columns that are going to be plotted"""

        if len(columns) != 2:
            raise ValueError('Function needs different columns')

        def column_fill_with_dummy(column: pd.Series, proportion_below: float = 0.10, jitter: float = 0.075, seed: int = 42) -> pd.Series:
            """
            Takes a column and if it has a missing value fills it with a outsider value
            """
            column = column.copy(deep= True)
            missing_mask = column.isna()
            number_missing_values = missing_mask.sum()
            column_range = column.max() - column.min()

            # The new dummy values will be under the minimum
            column_shift = column.min() - column.min() * proportion_below
            np.random.seed(seed)
            column_jitter = (np.random.rand(number_missing_values) - 2) * jitter * column_range
            column[missing_mask] = column_shift + column_jitter
            return column

        (
            self._obj[columns]
            .missing.bind_shadow_matrix(
                true_string= True,
                false_string= False
            )
            .apply(
                lambda column: column if '_NA' in column.name else column_fill_with_dummy(column)
            )
            .assign(
                nullity = lambda df: df[columns[0] + '_NA'] | df[columns[1] + '_NA']
            )
            .pipe(
                lambda df: sns.scatterplot(
                    data= df,
                    x= columns[0],
                    y= columns[1],
                    hue= 'nullity'
                )
            )
        )

He logrado llevar crear el metodo en la clase missing y agregar la funcion column_fill_with_dummies en utils.py