por qué aparece un archivo <strong><em>Thumbs.db</em></strong> en la carpetas de los ejercicios?

Son archivos temporales de windows (como ya te dijeron se usan para las miniaturas que se muestran en el explorador de archivos de windows), al ponerlo en tu servidor es más limpio que lo borres, también lo puedes eliminar de la carpeta del proyecto pero si usas windows es posible que se vuelva a crear.

Los archivos con nombre Thumbs.db hacen referencia a lo que podríamos llamar miniaturas, es decir, cuando accedemos al explorador de archivos y elegimos la vista Iconos pequeños, por ejemplo, veremos que en las fotografías podemos ver una pequeña previsualización de ellas, pero sin necesidad de abrirlas. Pues ese archivo contiene las miniaturas y puede haber uno por cada carpeta que tengas.

Normalmente están ocultos, por lo que no verás los archivos thumbs.db a menos que tengas activa la opción de "ver archivos ocultos" en el Explorador de Archivos, pero están ahí.