¿Cual es la diferencia entre module.exports y export default ? y ¿Cuando se debe de utilizar cada una?

Esto es porque Node decidió hacer JS modular antes que EcmaScript sacara los módulos de ES6 puedes aprender más de esto en el Curso de ECMAScript 6+

Hola Luis, acá hay un respuesta de stackoverflow que te puede ayudar a entender mejor la diferencia. Esta básicamente es el que porque el entorno no soporta nativamente ES6 y necesitarías usar babel o algo por el estilo para poder utilizarlo.