Hola, disculpen la ignorancia, pero sails.js tiene alguna relación con vue.js? Se debe elegir uno u otro para trabajar o conviven?

No tiene relacion alguna, el boilerplate lo tienen montado con vuejs, pero puedes incorporar el sistema de template que quieras, en su pagina oficial te explican como incorporar angular o react si lo deseas.

Sailjs basicamente se encarga de montarte el MVC para que el desarollo en nodejs se parezca mucho a como si estuvieras desarollando en ruby on rails.

Sails es un framework mvc para construir aplicaciones 100% en javascript, tanto el backend como el frontend, y si se puede trabajar en el frontend con Vue.JS, en cuanto a si tienen relación no, son proyectos de comunidades diferentes, puede que existan colaboradores comunes en los proyectos pero son independientes. Te dejo un código que encontré de ejemplo para que revises como se integra vue y sailshttps://github.com/ndabAP/vue-sails-example