Es mejor usar grid-column-start/end o grid-template-area?

Todo dependerá de tu diseño y de como se te sea más fácil, a muchos le funciona más el template are mientras que a otros no, sin embargo, te aseguro que se pueden mezclar, incluso con flexbox.

Gracias, sería buena idea poner grid-template-area como un organizador genereal y luego cada area dividirlo usando grid-colum/row?

A mi me funciona más usar grid-template-area porque me facilita generar el responsive de mi sitio web y se me hace mas sencillo que definir cada columna individualmente.