puedo usar workbench en lugar de phpmyadmin?

Yo utilizo los 2 pero las ventajas de workbench son el modelado de las entidades y sus relaciones, y una que me sirve mucho son importar backups, tengo archivos de mas de 50MB que si uno los quiere subir desde phpmyadmin debe editar el archivo php.ini para poder enviar por post archivos de ese tamaño ademas de aumentar el tiempo de ejecución y muchas veces no es garantia de nada, pues tarde que temprano se revienta el request, en cambio workbench permite la importacion de archivos grandes ya que no envia todo el script de una si no que para cada mil lineas sin afectar el tiempo maximo de ejecucion.

Hola, puedes usar cualquier gestor de base de datos.

Creo que si, mientras tu firewall solo permita el acceso al pc desde el que te conectas.