Buenas tardes, tengo el siguiente error <code>TypeError: db.collection is not a function </code>

El hecho dice que MongoLib no puede invocarse sin

Primero me salio un error: TypeError: Class constructor MongoLib cannot be invoked without 'new'

Le quite el new... y despues me dice

events.js:292
      throw er; // Unhandled 'error' event
      ^

Error: listen EADDRINUSE: address already in use :::4000
    at Server.setupListenHandle [as _listen2] (net.js:1313:16)
    at listenInCluster (net.js:1361:12)
    at Server.listen (net.js:1447:7)
    at Function.listen (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/express/lib/application.js:618:24)
    at Object.<anonymous> (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/index.js:30:5)
    at Module._compile (internal/modules/cjs/loader.js:1137:30)
    at Object.Module._extensions..js (internal/modules/cjs/loader.js:1157:10)
    at Module.load (internal/modules/cjs/loader.js:985:32)
    at Function.Module._load (internal/modules/cjs/loader.js:878:14)
    at Function.executeUserEntryPoint [as runMain] (internal/modules/run_main.js:71:12)
Emitted 'error' event on Server instance at:
    at emitErrorNT (net.js:1340:8)
    at processTicksAndRejections (internal/process/task_queues.js:84:21) {
  code: 'EADDRINUSE',
  errno: 'EADDRINUSE',
  syscall: 'listen',
  address: '::',
  port: 4000
}
[nodemon] app crashed - waiting for file changes before starting...

Es por la forma en que te está conectando a la base de datos, vi tu código y en realidad te está conectando a la base, luego a la colección, luego estás cerrando la conexión del cliente y estás regresando la variable

Con Mongo solo debes usar una conexión en lugar de estar abriéndola y cerrrándola. Aquí te dejo un código de un proyecto donde me conecto a una base de Mongo

const { MongoClient } = require('mongodb')
const config = require('../config')
const debug = require('debug')('app:mongo')

const USER = encodeURIComponent(config.dbUser)
const PASSWORD = encodeURIComponent(config.dbPassword)
const DB_NAME = config.dbName
const MONGO_URI = `mongodb+srv://${USER}:${PASSWORD}@${config.dbHost}/${DB_NAME}?retryWrites=true&w=majority`

class MongoLib {
  constructor() {
    this.client = new MongoClient(MONGO_URI, { 
      useNewUrlParser: true, 
      useUnifiedTopology: true 
    })
    this.dbName = DB_NAME
  }

  async connect() {
    if (!MongoLib.connection) {
      try {
        await this.client.connect()
        debug('Connected successfully to mongo')
        MongoLib.connection = this.client.db(this.dbName)
      } catch (error) {
        debug(error)
      }
    }
    return MongoLib.connection
  }

}

module.exports = MongoLib

Si en la consola me dice que no puede leer la propiedad 'collection' de undefined:

[nodemon] 2.0.4
[nodemon] to restart at any time, enter `rs`
[nodemon] watching path(s): *.*
[nodemon] watching extensions: js
[nodemon] starting `node graphql index index.js`
Server is listening at http://localhost:4000/api
TypeError: Cannot read property 'collection' of undefined
    at getCourses (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/lib/resolvers.js:14:28)
    at processTicksAndRejections (internal/process/task_queues.js:97:5)
    at async Promise.all (index 0)
    at async graphqlMiddleware (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/express-graphql/index.js:166:18)
(node:4163) UnhandledPromiseRejectionWarning: MongoError: Topology is closed, please connect
    at processWaitQueue (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/core/sdam/topology.js:1009:42)
    at NativeTopology.selectServer (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/core/sdam/topology.js:448:5)
    at executeWithServerSelection (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/operations/execute_operation.js:137:12)
    at executeOperation (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/operations/execute_operation.js:75:7)
    at CommandCursor._initializeCursor (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/core/cursor.js:531:7)
    at CommandCursor._initializeCursor (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/cursor.js:184:11)
    at nextFunction (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/core/cursor.js:734:10)
    at CommandCursor._next (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/core/cursor.js:201:5)
    at fetchDocs (/Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/cursor.js:832:16)
    at /Volumes/Data/DEV/GRAPHQL/platzi-dir/node_modules/mongodb/lib/cursor.js:855:7
(node:4163) UnhandledPromiseRejectionWarning: Unhandled promise rejection. This error originated either by throwing inside of an async function without a catch block, or by rejecting a promise which was not handled with .catch(). To terminate the node process on unhandled promise rejection, use the CLI flag `--unhandled-rejections=strict` (see https://nodejs.org/api/cli.html#cli_unhandled_rejections_mode). (rejection id: 1)
(node:4163) [DEP0018] DeprecationWarning: Unhandled promise rejections are deprecated. In the future, promise rejections that are not handled will terminate the Node.js process with a non-zero exit code.

Hola @blurdesigner no te lanza algún error en tu consola? la base de datos que estás consultando sí tiene información agregada? Porque podría pasar que esté teniendo un error que se atrapa en el catch y te devuelve el array vacío que inicializaste o simplemente la colección que está consultando no tiene información.

Hola @Luis_LiraC a mi en GraphiQL me devuelve un array vacío:

{
  "data": {
    "getCourses": []
  }
}

Qué podrá estar mal???

Aquí está mi código: https://github.com/iblurdesigner/graphql/tree/hotfix

Genial, mucho éxito :D 💚 ¡Nunca pares de aprender!

Luis muchas gracias, ya supere el problema con su ayuda. Si era un problema de versión

  "dependencies": {
    "dotenv": "^8.2.0",
    "express": "^4.17.1",
    "express-graphql": "^0.11.0",
    "graphql": "^15.3.0",
    "graphql-tools": "^6.0.12",
    "mongodb": "^3.5.9"
  },

Podrías desinstalar mongo con npm uninstall mongo mongodb, borrar la carpeta de node_modules, el package-lock.json y luego instalar todo de nuevo, junto con la versión más reciente de mongodb con npm i mongodb@latest. Actualmente mongodb está en la versión 3.5.9 y ahí tienes la 2.2.33.

Creo que si puede ser la versión de Mongo, le copio lo que tengo en package.json

dependencies": {
    "dotenv": "^8.2.0",
    "express": "^4.17.1",
    "express-graphql": "^0.11.0",
    "graphql": "^15.3.0",
    "graphql-tools": "^6.0.12",
    "mongo": "^0.1.0",
    "mongodb": "^2.2.33"
  },
  "devDependencies": {
    "nodemon": "^2.0.4",
    "standard": "^14.3.4"
  },

Cuando ejecuto con los cambios me sale este error.

the options [useNewUrlParser] is not supported
the options [useUnifiedTopology] is not supported

y en el explorador

{
  "message": "Failed to fetch",
  "stack": "TypeError: Failed to fetch"
}