Una pregunta, esto serviría para alojar un proyecto web, no solo una pagina sino un sistema completo?

Y sí, específicamente, en GitHub Pages podrías tener un sitio web mucho más completo que el que Freddy subió. Claro, si me hablas de un sistema completo, debe ser algo implementado para página web.

Claro que sí. Git y GitHub sirven precisamente para eso, para guardar proyectos complejos donde sin ellos no sería fácil poder mantenerlos y navegar entre ellos. En una sola carpeta donde inicies todo el repositorio puedes tener cantidades de carpetas y archivos que hacen parte de tu gran proyecto, y todo guardarlo con seguridad y tenerlo en la nube. ;)