recomendaciones a la hora de crear base de datos?

Normalmente la eliminación de datos es lógica, pero no física, es decir que nunca se borra nada de la base de datos. Te servirá para sacar algún tipo de estadística o para alguna auditoría interna o externa.

Tener bien clara la información que estarás guardando, qué tipos de datos, longitudes, normalizar en papel antes de ponerte a crearla dentro del gestor, pensar qué se podrá hacer y no por los usuarios para que también tu base de datos esté preparada, por ejemplo, qué pasará si un usuario quiere borrar algo, pero por tu modelo de negocio la información no puede ser realmente eliminada por la base de datos, etc.