Dentro de la metodología BEM, ¿Un bloque puede tener como elementos a otros bloques? O sería mejor ignorar el “potencial” bloque padre de...

Que tal, por lo regular todas las metodologías que encapsulan la lógica de tus componentes es relativo a tu desición. Sin embargo, en ocasiones BEM queda segado por esos inconvenientes que mencionas por ello te recomiendo adicionarle u optar por Atomic Design

Te invito a que investigas en StateOfCSS y veas las tendencias de desarrollo con CSS.

Hola Manuel como estas?, Así es, es una estructura anidada, un bloque maestro seguido de otros bloques dentro, te adjunto la documentación para que la leas, es muy interesante.