?En el caso de UBUNTU se actualizaba los indices para actualizar la fuente de donde descargan los paquetes pero por en CENTOS no es neces...

En el caso de yum update, la lista de repositorios es actualizada, descarga los paquetes y los actualiza. Si corres yum upgrade realizará el mismo procedimiento pero borrando los paquetes obsoletos. En el caso de que requieras saber qué paquetes están disponibles para actualización, primero debes correr el comando yum check-update. SUPONGO que el funcionamiento tiene que ver con que los repos default son de confianza y siempre activos, y que manejan las adiciones por EPEL, pero no estoy seguro. A seguir investigando.