Cuando el profe listo las llaves ssh, apareció una con extensión .pem. Como se usa esta llave y en que casos Usarla ?

PD: Si los certificados no están validados por una entidad segura saltará un aviso de seguridad en tu web o conexión indicandolo.

Bien, los archivos de extensión .pem (Privacy Enhanced Mail) son los archivos de certificado que pueden contener: la llave pública, la llave privada y los certificados de root. Es usado por ejemplo en páginas web cuando nos conectamos con el protocolo https, estos certificados .pem deben estar previamente certificados por un organismo público en tu país, aunque por ejemplo, ionos o 1&1 anteriormente también te provee de estos certificados ya validados por un coste adicional en tus servicios de hosting. https://www.ionos.es/seguridad/certificado-ssl