¿los software de diseño aplicado a ciencia e ingenieria com AutoCAD ó Solidworks funcionan bien en linux?

Para ese tipo de softwares lo mejor es trabajarlos desde windows.

Existen sus versiones para Linux pero desconozco que tan bien funcionan.

En mi experiencia este tipo de software reciben más atención (update, parches de seguridad) de sus desarrolladores cuando son de la plataforma más usada, en este caso Windows.