cuando ejecuto el comando cd ~ me envia a la carpeta root pero yo quiero que me envie a l raiz de mi usuario. ¿como puedo cambiar esto?

lo que ocurre es que el comando

cd ~

te lleva a la carpeta raíz del usuario que esta logueado, en tu caso estas logueado como root, y la carpeta raíz de root es /root y las de los demas usuarios están en /home , si tu quisieras que como root al escribir cd ~ te llavara a otra carpeta tienes que cambiar el valor de la variable ~ pero no te lo recomiendo por que esa variable se usa para varias configuraciones de sistema y puedes romper algo en especial si estas logueado como root

Si hicistes un "sudo su" estás logeado como superusuario. Por lo tanto "cd ~" te llevará a /root. Para ir al directorio raiz de tu usuario con "cd ~" tiene que salir de root previamente. Puedes salir haciendo un "exit".