El self se tiene que colocar si o si en las clases y en las instancias? El método es una función normal pero dentro de una clase? Las ins...

self se utiliza para el constructor y los métodos Def dentro de una clase es un metodo y fuera de ella es una funcion

En las instancias no es necesario, en las instanias sólo colocas los atributos, tomando como ejemplo el código del vídeo.

Quieres crear una coordenada 3, deberías póner los atributos de la siguiente forma

coord_3 = Coordenada(5, 9)

De esta forma ya creaste una instancia sin usar el self. El self es para cfrear una nueva clase cuando usas init o creas un método de clase.

El metodo self dentro de una clase hace referencia a ella misma. al momento de utilizarlo en el constructor de la clase (en el init) lo que hacemos es decir, que la propiedad X de la clase, va a ser igual al valor recibido.

class Casa:
	# cuartos y pisos son los parametros que recibo
	def __init__(self, cuartos, pisos):
	# con self, indico que MI variable cuartos es igual al 		parametro "cuartos" recibido.
	self.cuartos = cuartos
	# en este ejemplo, indico que MI variable misPisos es igual al parametro pisos recibido
	self.misPisos = pisos

Es importante el self porque recuerda que tu estas creando esa variable para esa clase, entonces con self le dices que esa propiedad es de ella.