según html semántico deberiamos colocar en la etiqueta header dentro de main ?

En lo personal prefiero tener los 3 elementos principales, header, main, footer, separados por que ya el body incluye a los 3 no hay necesidad de tener un elemento que envuelva estos 3, además que si metes el header y el footer adentro de el main, necesitarias otro contenedor entre el header y footer para representar el contenido principal, no tiene sentido para mi al menos.

Hola de nuevo jaja, depende. No es obligatorio pero tampoco estaría mal, hay una gran controversia en este tema, muchos consideran que el header y el footer son parte del main, mientras otros sostenemos que no en base a la documentación. Espero haberte aclarado un poco la situación porque es muy confusa en este tema. ¡Saludos!