Cual es la diferencia entre window y this?

Windows es a this como el mouse es al raton. Espero haberte ayudado

This se refiere al objeto desde donde se invocó una función. Por otro lado, el objeto window es el objeto principal en la jerarquía y contiene las propiedades y métodos para controlar la ventana del navegador.

Fuera de cualquier contexto de ejecución, this es una referencia a window