En las auditorías de lighthouse, recomeindan usar JPEG 2000, JPEG XR, y WebP. Esto es adecuado? He visto que WebP si es soportado en casi...

Hola! Los formatos que recomienda Lighthouse es porque estos están mejor optimizados, normalmente sí sería lo recomendable, aunque habrá ocasiones que por x o y situación no podamos cumplir estrictamente todo lo que nos menciona Lighthouse para poder pasar su verificación.

Recuerda que son pruebas de laboratorio, y lo más importante es que la experiencia de usuario es la que se vea beneficiada por las optimizaciones que logres. Si tu sitio cumple con la mayoría de los puntos, carga rápido en dispositivos y redes lentes a pesar de que no uses esos formatos, no veo obligatorio que debas usarlos.

A mi parecer es mejor usar un formato que todos o la mayoría de los navegadores acepten para dar soporte al mayor número de personas.