Todavia no entiendo la diferencia entre usar la terminal de linux (Ubuntu o Windows Terminal) y el visualizador de código Visual Studio C...

Ciertamente no hay ninguna diferencia, puedes realizar todo lo que requieres en una u otra terminal, desde ejecucion del servidor hasta el manejo del repositorio de git, no obstante considero que es bueno mantener una terminal dedicada a tu repositorio, mientras que la de VSC a lo relacionado a tu app, de esta manera puedes evitar posibles errores y mantienes comandos dedicados a una tarea por separado.