Que recomendarías a utilizar con .Net , C++ o C#, siempre he tenido esa duda puesto conozco ambos pero no sé en qué momentos sería buena ...

C++ no es compatible con .NET, Microsoft tienen una version adaptada que sigue los estandares de CLS se llama Visual C++. Yo recomendaria usar C# por que son muchos los cambios y adaptaciones que a tenido para ser mas simple y combinar perfectamente con las librerias de .NET