Recomendaciones de Arquitectura y Paso a Producción

Resumen

Usar proveedores cloud con alta disponibilidad: AWS, Google Cloud o Azure son muy buenas opciones
No te compliques pensando en administración de servidores con MongoDB, servicios como MongoDB Atlas o mlab son muy buenas opciones
Guardar las credenciales en variables de entorno o archivos de configuración fuera del proyecto
Asegura que tu cluster se encuentra en la mis región del proveedor que tu aplicación
Has VPC peering entre la VPC de tu aplicación y la VPC de tu cluster
Cuida la lista de IPs blancas
Puedes habilitar la autenticación en dos pasos
Actualiza constantemente tu versión de MongoDB
Separa los ambientes de desarrollo, test y producción
Habilita la opción de almacenamiento encriptado