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Modelos SIR y el Número Básico de Reproducción (R₀)

Clase 11 de 12 • Taller de Aplicación de Modelos Numéricos

Contenido del curso

Modelos matemáticos

  • 1
    Modelos Matemáticos: Conceptos Básicos y Aplicaciones

    Modelos Matemáticos: Conceptos Básicos y Aplicaciones

    04:24 min
  • 2
    Modelado de Sistemas Dinámicos con Funciones Matemáticas y Python

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    04:29 min
  • 3
    Ecuaciones Diferenciales Ordinarias: Modelos de Epidemias

    Ecuaciones Diferenciales Ordinarias: Modelos de Epidemias

    05:09 min
  • 4
    Resolución de EDOs para Modelar Epidemias con Python

    Resolución de EDOs para Modelar Epidemias con Python

    03:24 min
  • 5
    Convección y Sistemas Dinámicos: El Modelo de Lorenz

    Convección y Sistemas Dinámicos: El Modelo de Lorenz

    04:05 min

Modelos númericos

  • 6
    Método de Euler: Solución Numérica de Ecuaciones Diferenciales

    Método de Euler: Solución Numérica de Ecuaciones Diferenciales

    03:19 min
  • 7
    Solución Numérica y Exacta de Ecuaciones Diferenciales

    Solución Numérica y Exacta de Ecuaciones Diferenciales

    03:54 min

Sistemas caóticos

  • 8
    Comparación de Métodos: Runge-Kutta 4 vs Euler en Ecuaciones Diferenciales

    Comparación de Métodos: Runge-Kutta 4 vs Euler en Ecuaciones Diferenciales

    02:33 min
  • 9
    Resolución del Sistema de Lorenz con Método RK4

    Resolución del Sistema de Lorenz con Método RK4

    03:32 min

Modelos epidemiológicos

  • 10
    Modelo SIR: Simulación Numérica de Epidemias con RK4

    Modelo SIR: Simulación Numérica de Epidemias con RK4

    03:39 min
  • 11
    Modelos SIR y el Número Básico de Reproducción (R₀)

    Modelos SIR y el Número Básico de Reproducción (R₀)

    Viendo ahora
  • 12
    Modelado Epidemiológico con SIRD y Algoritmo de Evolución Diferencial

    Modelado Epidemiológico con SIRD y Algoritmo de Evolución Diferencial

    04:41 min
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      Ahora que hemos discutido y solucionado un modelo SIR:

      Screenshot_64.png

      Estamos listos para:

      1. Dar unos comentarios adicionales para identificar en qué momento una epidemia puede alcanzar su pico de contagios y decaer a partir de entonces.
      2. Dar el paso siguiente a un modelo que considera un compartimiento adicional que corresponderá a los individuos que fallecen por causa de la epidemia.

      Número básico de reproducción

      Matemáticamente hablando, para garantizar que en algún momento el número de contagios empiece a reducirse debe cumplirse que la tasa de crecimiento de I sea negativa, es decir:

      Screenshot_65.png

      Y esto sucederá cuando tengamos que el otro lado de la ecuación [2] también cumpla esa condición:

      Screenshot_66.png

      Como el número de infectados nunca puede ser negativo, esto se reduce a decir que βS - μ < 0. Aquí vemos un inconveniente con esta desigualdad y es que los parámetros de nuestro modelo deben tener unidades de [1/tiempo] pues reflejan una tasa de propagación. Es decir, puestas así se interpretan como el inverso del tiempo que demora en aparecer o desaparecer un nuevo infectado.

      Para ver porqué esto es un inconveniente, haremos un análisis dimensional sobre la ecuación [2], el propósito de esto es garantizar que todos los factores de una igualdad matemática tengan las mismas unidades, o dicho de forma simple, que uno esté restando o sumando naranjas con naranjas, ya que no tiene sentido comparar objetos diferentes. Esto sería como decir tengo 3 naranjas y me como 2 piñas, entonces me queda ahora solo 1 manzana:

      image29.png

      Para garantizar que todos los términos de mi ecuación son naranjas veo que debe cumplirse que:

      Screenshot_68.png

      Y vemos que μ si tiene las unidades adecuadas, pero β no, por esto es común que en epidemiología se normalice el término β (S - I) por β (S/N - I) de manera que, ahora que dividimos S por la población total, esto queda en un número que llamamos adimensional, pues ahí estamos dividiendo individuos/individuos y se cancelan las unidades. El resultado es que esto cambia el valor de nuestro parámetro β por un factor constante, y esto se puede hacer sin perder generalidad en el modelo. Así, el sistema ahora queda:

      Screenshot_70.png
      Screenshot_71.png

      Y de esto ya tenemos que ambos parámetros tienen las mismas unidades, pero ahora la condición para garantizar reducción en el número de infectados cambia de βS - μ < 0 a:

      Screenshot_73.png

      O mejor:

      Screenshot_74.png

      Donde hemos definido R₀ = β / μ y esta cantidad se llama el número básico de reproducción. Este número se interpreta como el número promedio de personas que infecta un individuo infectado, por cada unidad de tiempo. Entonces:

      1. Si R₀ < 1, la desigualdad [7] nos dice que es imposible que el virus se propague. Por ejemplo, si N=100 y R₀ = 0.8, entonces S <125, lo cual sucede desde el principio porque asumimos que el número de susceptibles es igual a N desde el inicio y eso implica que la curva no podrá crecer nunca.
      2. Si R₀ > 1, la desigualdad [7] nos dice que el virus se puede propagar pero eventualmente podrá empezar a decaer. Por ejemplo, si N = 100 y R₀ = 2, entonces S < 50, lo cual quiere decir que la curva de infectados habrá alcanzado su máximo cuando la mitad de la población haya sido infectada.

      Reto: Modifica el notebook de la clase pasada para que en la clase SIR_model() consideremos las nuevas ecuaciones [4], [5] y [6]. Luego, haz dos simulaciones: una con R₀ < 1 y otra con R₀ > 1. Observa y analiza el resultado de cada simulación, publica tus resultados en la sección de comentarios. ¿Coincide el resultado con lo discutido previamente en esta clase?

      Comentarios

        DIEGO ALEXANDER ARISTIZABAL ARISTIZA

        DIEGO ALEXANDER ARISTIZABAL ARISTIZA

        student•
        hace 3 años

        Hola equipo platzi y compañeros de estudio, en este punto me vendria un poco de ayuda, porque aunque vengo con disciplina realizando tods los curso de la escuela de matemática, aun no domino completamente el tema.

        me falta mas acompañamiento de un tutor (por lo menos que esplique en un video como realizar el taller), tal vez pida mucho, pero hago la solicitud desde mi necesidad.

        agradezco la persona que lea este comentario y me pueda orientar en esta solución.

        Muchas gracias,

        Eduardo Monzón

        Eduardo Monzón

        student•
        hace 3 años

        Con un tercer comportamiento el modelo llega a ser más "real" y a su vez más sofisticado, necesiando que se tengan muchos más detalles en cuenta.

        Ilia Adad Infante Trejo

        Ilia Adad Infante Trejo

        student•
        hace 3 años

        Pensé que no lo lograría pero ya llegué al final