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Curso de Manejo de Datos Faltantes: Imputación

Tratamiento de variables categóricas para imputación: codificación ordinal

Curso de Manejo de Datos Faltantes: Imputación

Contenido del curso

Problemática de valores faltantes

  • 1
    El problema de trabajar con valores faltantes

    El problema de trabajar con valores faltantes

    10:56 min
  • 2
    Proceso de análisis y limpieza de datos

    Proceso de análisis y limpieza de datos

    13:19 min
  • 3
    Visualizar y eliminar valores faltantes

    Visualizar y eliminar valores faltantes

    08:19 min
  • 4
    Implicaciones de los distintos tipos de valores faltantes

    Implicaciones de los distintos tipos de valores faltantes

    09:43 min
  • 5
    Amplía tu conjunto de herramientas para explorar valores faltantes

    Amplía tu conjunto de herramientas para explorar valores faltantes

    11:55 min
  • 6
    Tratamiento de variables categóricas para imputación: codificación ordinal

    Tratamiento de variables categóricas para imputación: codificación ordinal

    Viendo ahora
  • 7
    Tratamiento de variables categóricas para imputación: one-hot encoding

    Tratamiento de variables categóricas para imputación: one-hot encoding

    12:51 min
  • 8
    Métodos de imputación de valores faltantes

    Métodos de imputación de valores faltantes

    04:41 min

Imputación basada en el donante

  • 9
    Imputación por media, mediana y moda

    Imputación por media, mediana y moda

    10:22 min
  • 10
    Imputación por llenado hacia atrás y hacia adelante

    Imputación por llenado hacia atrás y hacia adelante

    09:20 min
  • 11
    Imputación por interpolación

    Imputación por interpolación

    11:46 min
  • 12
    Imputación por KNN

    Imputación por KNN

    04:34 min
  • 13
    Imputación por KNN en Python

    Imputación por KNN en Python

    12:01 min

Imputación basada en modelos

  • 14
    Introducción a la imputación basada en modelos

    Introducción a la imputación basada en modelos

    13:27 min
  • 15
    Imputaciones Múltiples por Ecuaciones Encadenadas (MICE)

    Imputaciones Múltiples por Ecuaciones Encadenadas (MICE)

    13:05 min

Conclusión

  • 16
    Transformación inversa de los datos

    Transformación inversa de los datos

    07:07 min
  • 17
    ¿Cómo continuar practicando?

    ¿Cómo continuar practicando?

    03:09 min
Tomar examen

Tratamiento de variables categóricas para imputación: codificación ordinal

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      Miguel Ángel Acosta Rocha

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        Luis Cerén

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        Eugenio Schiavoni

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      Carlos Mazzaroli

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      Jeinfferson Bernal G

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      Alfonso Andres Zapata Guzman

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        Alfonso Andres Zapata Guzman

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      Esteban Navarro Díaz

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      Andres Sanchez

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        Pablo Alejandro Figueroa

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      Jeinfferson Bernal G

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      Roberth Mafla

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      Sergio Véliz

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        Pablo Alejandro Figueroa

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      Mario Alexander Vargas Celis

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      Mauricio Escobar

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      Miguel Carvajal

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      José Alejandro Montes Juarez

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      Alejandro Senger

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      Antonio Demarco Bonino

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      Nixon Rolando García Ramírez

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        Pablo Alejandro Figueroa

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      Nixon Rolando García Ramírez

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        Pablo Alejandro Figueroa

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      Darrien Sequera

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      Eugenio Schiavoni

      Eugenio Schiavoni

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      Hace 3 años

      Siento que estas clases han sido full técnicas y cargadas... nada fácil

      Hace falta un cursito previo de janitor

      Es verdad eso, pero explican muchas cosas muy útiles que cuando uno no las sabe pierde mucho tiempo programando algo que ya existe y lo hace mejor que uno ! Hay que ir con calma, tener buenas bases en estadística, probabilidad y cálculo en general, y lo mas importante practicar mucho!!

      me hubiera servido la codificación ordinal en el curso de EDA 🐠

      Tratamiento de Variables categoricas para imputacion: Codificacion Ordinal

      La mayor parte de las variables categoricas son cadenas de textos y por tanto realizar operaciones con ellas no es trivial. Es asi como surge la necesidad de convertir o codificar las cadenas de texto a numeros de manera que los algoritmos puedan entenderlos o asociarlos

      Codificacion Ordinal

      Consiste en mapear cada elemento unico de texto a un numero entero. Una vez realizada la codificacion podemos comenzar el proceso de imputacion introduciendo los datos a un algoritmo de imputacion

      from sklearn import preprocessing nhanes_transformed_df_aazg = nhanes_df.copy(deep=True) label_encoder = preprocessing.LabelEncoder() encoder_gender = label_encoder.fit_transform(nhanes_transformed_df_aazg.gender) nhanes_transformed_df_aazg.gender = encoder_gender nhanes_transformed_df_aazg.head()

      En cuanto a las diferencias OrdinalEncoder y la LabelEncoder implementación , la respuesta aceptada menciona la forma de los datos:

      OrdinalEncoder es para datos 2D con la forma(n_samples, n_features) LabelEncoder es para datos 1D con la forma(n_samples,)

      Hay que actualizar el código para el método get_features_names_out(). No aparece en la versión más reciente de sklearn.

      6. Tratamiento de variables categóricas para imputación: codificación ordinal

      • La mayor parte de las variables categóricas son cadenas de texto.
      • Realizar operaciones con cadenas de texto NO es trivial.
      • Surge la necesidad de convertir o codificar las cadenas de texto a números.

      Codificación ordinal

      • Asignarle un valor numérico a cada categoría
      • Siempre antes de encodear hacerle una copia al df
      nhanes_transformed_df = ( pd.DataFrame( categorical_tranformer.fit_transform(nhanes_df), columns=categorical_tranformer.get_feature_names_out(), index = nhanes_df.index ) .rename_columns( function = lambda x: x.removeprefix('ordinalencoder__') ) .rename_columns( function = lambda x: x.removeprefix('remainder__')) ) # Apply categorical transformer to the data nhanes_transformed_df.head()

      genial, gracias!

      Aplicando la Codificacion Oordinal a todas las Variables de NHANES

      • Obtener las variables de tipo objeto y category
      nhanes_df.select_dtypes(include=[object, 'category'])
      Untitled.png
      • Obtener solo los nombres de las variables con valores de tipo object y category y guardarlos
      categorical_columns = nhanes_df.select_dtypes(include=[object, 'category']).columns categorical_columns --> Index(['general_health_condition', 'gender'], dtype='object')
      • Utiliza una funcion de sklearn para componer instrucciones de transformacion para los datos y guarda las transformaciones.
      categorical_transformer = sklearn.compose.make_column_transformer( # transformador variables a transformar (sklearn.preprocessing.OrdinalEncoder(), categorical_columns), remainder='passthrough' # permite omitir las demas variables para que no las transforme ) categorical_transformer
      Untitled (1).png
      • Crea un nuevo dataframe con los datos transformados.
      ( pd.DataFrame( categorical_transformer.fit_transform(nhanes_df) ) )
      Untitled (2).png
      • Agrega los nombres de las variables nuevamente
      nhanes_transformed_df = ( pd.DataFrame( categorical_transformer.fit_transform(nhanes_df), columns=categorical_transformer.get_feature_names_out(), index=nhanes_df.index # vuelve a los indices del dataframe original ) .rename_columns( function = lambda x: x.removeprefix('ordinalencoder__') ) .rename_columns( function = lambda x: x.removeprefix('remainder__') ) ) nhanes_transformed_df
      Untitled (3).png

      Siento que hay un error cuando explica la codificación ordinal, la codificación ordinal se utilizan cuando las categorías siguen un orden, por ejemplo una calificación que sea, bajo, medio, alto. De lo contrario en el caso de los animales es nominal.

      Con el siguiente código pueden obtener las clases de sus variables categóricas del DataFrame que se generó en el minuto 13:30

      # Obtener el transformer print('Transformers: ', categorical_transformer.transformers_, end='\n\n\n') # Del transformer obtener las categorías y significados de los numeros generados print('Categorias o clases: ', categorical_transformer.transformers_[0][1].categories_)

      gracias..!

      Ejemplo de Codificacion Ordinal mediante una Lista

      • Dado un conjunto de datos con dos caracteristicas, encontraremos los valores unicos por caracteristica y los transformaremos utilizando una codificacion ordinal
      X = [['Male'], ['Female'], ['Female']] X --> [['Male'], ['Female'], ['Female']]
      • Creamos un encoder para agrupar la informacion y codificarla
      encoder = sklearn.preprocessing.OrdinalEncoder()
      • Codificamos la lista anterior
      encoder.fit_transform(X) --> array([[1.], [0.], [0.]])
      • El hombre quedo con la codificacion 1 y la mujer con 0. Para cuando hay muchas categorias utilizamos el metodos categories_
      encoder.categories_ --> [array(['Female', 'Male'], dtype=object)]
      • Calcular la inversa de la transformacion de manera que si hay un 1 aparezca un hombre y si hay un 0 aparezca una mujer
      encoder.inverse_transform([[1],[1],[0]]) --> array([['Male'], ['Male'], ['Female']], dtype=object)

      El tratamiento de variables categóricas para imputación es un paso importante en la limpieza de datos, ya que la mayoría de los métodos de imputación (como la media, la mediana o incluso modelos más avanzados como KNN o regresiones) requieren que las variables categóricas estén codificadas numéricamente.

      La **codificación ordinal** es una técnica que convierte las categorías en números de manera que las categorías tengan un orden lógico, pero sin implicar una relación de magnitud precisa entre las categorías.

      ### ¿Qué es la codificación ordinal?

      La **codificación ordinal** se utiliza cuando las categorías de una variable tienen un orden inherente. Un ejemplo común es una variable de satisfacción con las opciones: "Bajo", "Medio", "Alto". El orden es claro, y se puede representar con números como 1, 2, y 3, donde 1 representa "Bajo" y 3 representa "Alto".

      Este tipo de codificación es ideal para variables categóricas ordinales, en las que las categorías pueden ordenarse de manera lógica.

      ### Pasos para la imputación con codificación ordinal:

      1. **Identificación de las variables ordinales**: Primero, debes identificar las variables categóricas que tienen un orden lógico entre sus categorías. Por ejemplo:

      - Nivel educativo (Primaria, Secundaria, Universitaria).

      - Tamaño de una empresa (Pequeña, Mediana, Grande).

      2. **Codificación ordinal**: Convertir las categorías en valores numéricos que respeten el orden inherente. Para hacer esto, puedes usar la función OrdinalEncoder de sklearn o codificar manualmente.

      ```python

      from sklearn.preprocessing import OrdinalEncoder

      import pandas as pd

      # Ejemplo de datos categóricos

      data = {'Nivel_Educativo': ['Primaria', 'Secundaria', 'Universitaria', None]}

      df = pd.DataFrame(data)

      # Definir el orden de las categorías

      encoder = OrdinalEncoder(categories=[['Primaria', 'Secundaria', 'Universitaria']])

      # Codificar

      df['Nivel_Educativo_Cod'] = encoder.fit_transform(df[['Nivel_Educativo']])

      print(df)

      ```

      Salida:

      ```

      Nivel_Educativo Nivel_Educativo_Cod

      0 Primaria 0.0

      1 Secundaria 1.0

      2 Universitaria 2.0

      3 None NaN

      ```

      3. **Imputación**: Una vez que la variable ha sido codificada ordinalmente, puedes aplicar métodos de imputación estándar. Por ejemplo, imputar los valores faltantes utilizando la media o mediana en lugar de dejar los valores como NaN.

      ```python

      from sklearn.impute import SimpleImputer

      # Imputar la mediana en los valores faltantes

      imputer = SimpleImputer(strategy='median')

      df['Nivel_Educativo_Imputado'] = imputer.fit_transform(df[['Nivel_Educativo_Cod']])

      print(df)

      ```

      Salida:

      ```

      Nivel_Educativo Nivel_Educativo_Cod Nivel_Educativo_Imputado

      0 Primaria 0.0 0.0

      1 Secundaria 1.0 1.0

      2 Universitaria 2.0 2.0

      3 None NaN 1.0

      ```

      En este caso, el valor faltante se ha reemplazado por la mediana.

      ### Beneficios de la codificación ordinal

      1. **Imputación más precisa**: Al conservar el orden inherente de las categorías, la imputación de los valores faltantes será más precisa, ya que métodos como la media o la mediana pueden mantener la lógica de las relaciones entre las categorías.

      2. **Modelos más robustos**: Los modelos de Machine Learning y las técnicas estadísticas suelen funcionar mejor con datos numéricos, y la codificación ordinal facilita el uso de estos modelos para variables categóricas.

      3. **Evita la codificación arbitraria**: En lugar de usar números sin sentido o hacer una codificación "one-hot" que puede introducir complejidad innecesaria, la codificación ordinal refleja el orden real de las categorías.

      ### Cuándo no usar codificación ordinal

      No todas las variables categóricas deben ser codificadas ordinalmente. **Solo** debes aplicar esta técnica si las categorías tienen un **orden lógico**. Si las categorías no tienen un orden, deberías usar otras técnicas como la **codificación "one-hot"** o **frecuencial**.

      ### Conclusión

      La codificación ordinal es una técnica efectiva cuando necesitas imputar valores faltantes en variables categóricas con un orden implícito. La clave es respetar el orden de las categorías, para luego poder aplicar métodos de imputación y análisis que te proporcionen resultados precisos y consistentes.

      alternativa para el buen janitor:

      Por medio de una función anónima (lambda) haremos un split, tomando como referencia al "__" quedándonos con la segunda parte[1] de dicho split.

      • Ejemplo: prefijo_nombre (nos quedamos con "nombre")
      #(5) df con cols transformadas df_transformed = pd.DataFrame(data= transformed_data, columns = categorical_transformer_ord.get_feature_names_out(), index= df_nh_copy.index) #(6) extraer el prefijo de las columnas: "ordinalencoder__" y "remainder__" df_transformed = df_transformed.rename(columns= lambda x: x.split('__')[1] if '__' in x else x)

      Le cambió la voz?

      Considero que el maestro si va un poco rapido, pero tambien hay que entender que para este punto ya debemos saber las bases que estan en otros cursos. A mi se me dificulto mucho la clase anterior y esta pero justo el curso que menciono en la anterior, no lo he cursado

      No me pude volver a concentrar en el video hasta que busque imagenes de la Turritopsis nutricola jajajaja

      No tiene nada que ver con el curso pero si son curiosos como yo acá les dejo lo que es una "Turritopsis nutricula": 'es una especie de hidrozoo hidroideo de la familia Oceanidae con un ciclo de vida en el que se revierte a pólipo después de llegar a su maduración sexual. Es uno de los casos conocidos de metazoo capaz de revertir su edad adulta a una edad sexualmente inmadura de forma individual. Otros animales biológicamente inmortales incluyen la medusa Laodicea undulata y Aurelia, así como la medusa del mismo género Turritopsis dohrnii.​ Es capaz de realizarlo a través de un proceso celular de transdiferenciación. Teóricamente, este ciclo puede repetirse indefinidamente, presentándose como biológicamente inmortal.'

      Es una especie de medusa, de esas que capturaba Bob Esponja.

      Y otra cosa, segun la documentacion de skearn, ya el comando

      encoder = sklearn.preprocessing.OrdinalEncoder()

      no funciona para eso lo que se debe realizar es

      from sklearn import preprocessing encoder = preprocessing.OrdinalEncoder()

      Eso es lo que dice la documentacion, y a mi me funciono asi, ya si a alguien le funciona de la primera forma no hay problema.

      Pueden buscar Skearn 6.3. Preprocesamiento de datos

      gracias!

      Algo curioso que me paso al momento de importar la libreria sklearn , es que me salia que no me aparecia, no se ejecutaba nada, cuando entre a la documentacion de sklearn , me entere que primero tenian que:

      use

      pip3 install scikit-learn

      en lugar de

      pip3 install sklearn

      reemplace sklearn por scikit-learn en sus archivos de requisitos de pip (requirements.txt, setup.cfg, Pipfile, etc...) si una de sus dependencias usa el paquete sklearn, sería genial si se toma un tiempo para rastrear qué paquete usa sklearn en lugar de scikit-learn e informarlo a su rastreador de problemas.

      Ya despues uno puede importar sklern de forma normal y con el mismo nombre

      import sklearn

      Lo comento pr si alguien esta siguiendo el ejercicio en otra aplicacion diferente a DeepNote.

      gracias--!

      Es importante acotar que para el mejor aprovechamiento del curso, hay que tener las bases de sklearn, lo cual no está en los requisitos del curso.

      Estaba haciendo un algoritmo justamente para hacer esto, estaba seguro que ya existía, que bien Platzi y que bien Sklearn!!