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Curso de Manejo de Datos Faltantes: Imputación

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Curso de Manejo de Datos Faltantes: Imputación

Contenido del curso

Problemática de valores faltantes

  • 1
    El problema de trabajar con valores faltantes

    El problema de trabajar con valores faltantes

    10:56 min
  • 2
    Proceso de análisis y limpieza de datos

    Proceso de análisis y limpieza de datos

    13:19 min
  • 3
    Visualizar y eliminar valores faltantes

    Visualizar y eliminar valores faltantes

    08:19 min
  • 4
    Implicaciones de los distintos tipos de valores faltantes

    Implicaciones de los distintos tipos de valores faltantes

    09:43 min
  • 5
    Amplía tu conjunto de herramientas para explorar valores faltantes

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    Viendo ahora
  • 6
    Tratamiento de variables categóricas para imputación: codificación ordinal

    Tratamiento de variables categóricas para imputación: codificación ordinal

    15:59 min
  • 7
    Tratamiento de variables categóricas para imputación: one-hot encoding

    Tratamiento de variables categóricas para imputación: one-hot encoding

    12:51 min
  • 8
    Métodos de imputación de valores faltantes

    Métodos de imputación de valores faltantes

    04:41 min

Imputación basada en el donante

  • 9
    Imputación por media, mediana y moda

    Imputación por media, mediana y moda

    10:22 min
  • 10
    Imputación por llenado hacia atrás y hacia adelante

    Imputación por llenado hacia atrás y hacia adelante

    09:20 min
  • 11
    Imputación por interpolación

    Imputación por interpolación

    11:46 min
  • 12
    Imputación por KNN

    Imputación por KNN

    04:34 min
  • 13
    Imputación por KNN en Python

    Imputación por KNN en Python

    12:01 min

Imputación basada en modelos

  • 14
    Introducción a la imputación basada en modelos

    Introducción a la imputación basada en modelos

    13:27 min
  • 15
    Imputaciones Múltiples por Ecuaciones Encadenadas (MICE)

    Imputaciones Múltiples por Ecuaciones Encadenadas (MICE)

    13:05 min

Conclusión

  • 16
    Transformación inversa de los datos

    Transformación inversa de los datos

    07:07 min
  • 17
    ¿Cómo continuar practicando?

    ¿Cómo continuar practicando?

    03:09 min
Tomar examen

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      Comentarios11

      Bryan Carvajal

      Bryan Carvajal

      Estudiante
      Hace 3 años
        Julián Cárdenas

        Julián Cárdenas

        Estudiante
        Hace 3 años
      Pablo Alejandro Figueroa

      Pablo Alejandro Figueroa

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      Hace 2 años
      Andres Sanchez

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      Estudiante
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      José Rodrigo Arana Hi

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      Mario Alexander Vargas Celis

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      José Pablo Cabrera Romo

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      Jeinfferson Bernal G

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      Francisco Javier Castillo Castillo

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      Rubén Téllez Gerardo

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      Pablo Alejandro Figueroa

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      Pablo Alejandro Figueroa

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      Estudiante
      Hace 2 años

      Solucion planteada por el profe:

      def missing_mosaic_plot( self, target_var: str, x_categorical_var: str, y_categorical_var: str, ax = None ): return ( self._obj .assign( **{target_var: lambda df: df.weight.isna().replace([True, False], ["NA", "!NA"])} ) .groupby( [x_categorical_var, y_categorical_var, target_var], dropna=False, as_index=True, ) .size() .pipe( lambda df: mosaic( data=df, properties=lambda key: {"color": "r" if "NA" in key else "gray"}, ax=ax, horizontal=True, axes_label=True, title="", labelizer=lambda key: "", ) ) )

      Gracias !

      Captura de pantalla 2024-02-03 121841.png
      Captura de pantalla 2024-02-03 145804.png

      5. Amplía tu conjunto de herramientas para explorar valores faltantes

      fig, ax = plt.subplots(figsize=(10,10)) ( nhanes_df .select_columns('weight','general_health_condition','gender') .assign( weight = lambda df: df.weight.isna().replace([True,False],['NA','!NA']) ) .groupby( ['gender','general_health_condition','weight'], dropna=False, as_index = True ) .size() .pipe( lambda df: mosaic( data = df, properties=lambda key: {'color':'r' if 'NA' in key else 'gray'}, horizontal=True, axes_label=True, title='', labelizer=lambda key: '', ax = ax ) ) );

      yo lo hice directo en el notebook, comparé el codigo y es similar. Noten que el código del profe en pandas_missing_extension tienen un detalle: cambien el nombre de la columna 'weight' por el parámetro definido en la función. **{target_var: lambda df: df.weight.isna().replace([True, False], ["NA", "!NA"])}

      Aquí mi código:

      def missing_mosaic_plot(df, cat1, cat2, var): fig, ax = plt.subplots(figsize=(10,10)) my_mosaic = ( df [[cat1, cat2, var]] .assign( **{ var: lambda df: df[var].isna().replace([False, True], ['!NA', 'NA']) } ) .groupby( [ cat1, cat2, var ], dropna=False, as_index=True ) .size() .pipe( lambda df: mosaic( df, properties=lambda key: { 'color': 'r' if 'NA' in key else 'c' }, horizontal=True, axes_label=True, title='', labelizer=lambda key: '', ax= ax ) ) ) # plt.show() return my_mosaic missing_mosaic_plot(nhanes_df, 'gender','general_health_condition', 'pulse')

      Para explorar y manejar valores faltantes de manera efectiva, es crucial ampliar las herramientas y técnicas que tienes a tu disposición. Aquí te dejo algunas herramientas y enfoques útiles que puedes implementar:

      ### 1. **Visualización de valores faltantes**:

      Existen varias librerías en Python que permiten visualizar valores faltantes de manera intuitiva:

      - **Matplotlib y Seaborn**: Úsalos para crear gráficos de calor o gráficos de barras que te permitan identificar la cantidad de valores faltantes.

      ```python

      import seaborn as sns

      import matplotlib.pyplot as plt

      sns.heatmap(df.isnull(), cbar=False)

      plt.show()

      ```

      - **Missingno**: Una librería especializada en la visualización de datos faltantes.

      ```python

      import missingno as msno

      # Visualización básica

      msno.matrix(df)

      # Visualización de dendograma para identificar patrones de valores faltantes correlacionados

      msno.dendrogram(df)

      ```

      ### 2. **Matriz de sombras**:

      Una técnica avanzada que permite crear una matriz binaria donde 1 indica la presencia de un valor y 0 indica su ausencia. Esto permite analizar las correlaciones entre la presencia de valores faltantes en diferentes variables.

      ```python

      import pandas as pd

      # Matriz de sombras

      shadow_matrix = df.isnull().astype(int)

      ```

      Esta técnica puede ser útil para identificar si la falta de datos en una columna está correlacionada con la falta de datos en otra.

      ### 3. **Correlación de nulidad**:

      Explorar la relación entre valores faltantes en diferentes columnas es clave para entender el origen de los valores faltantes. Esto se puede hacer usando la función pandas.DataFrame.corr() para calcular la correlación entre la matriz de nulidad.

      ```python

      # Calcular la correlación entre valores faltantes

      nullity_corr = df.isnull().corr()

      ```

      También puedes calcular correlaciones específicas con valores faltantes usando el método pairwise deletion o la imputación de valores como último recurso.

      ### 4. **Imputación de valores faltantes**:

      Hay múltiples enfoques que puedes usar para imputar valores faltantes:

      - **Imputación por la media/mediana/moda**: Fácil de implementar, pero puede sesgar los resultados.

      ```python

      df['column'].fillna(df['column'].mean(), inplace=True)

      ```

      - **Imputación usando métodos más avanzados**:

      - **K-Nearest Neighbors (KNN)**: Este método utiliza las observaciones más cercanas para imputar valores faltantes.

      - **Iterative Imputer**: Realiza imputaciones iterativas en las columnas del conjunto de datos utilizando un modelo de regresión.

      ```python

      from sklearn.impute import KNNImputer

      imputer = KNNImputer(n_neighbors=5)

      df_imputed = imputer.fit_transform(df)

      ```

      ### 5. **Análisis de patrones de valores faltantes**:

      Identificar patrones en los datos faltantes te ayudará a elegir la estrategia adecuada. Existen tres tipos de valores faltantes:

      - **MCAR (Missing Completely at Random)**: No hay patrón.

      - **MAR (Missing at Random)**: Los valores faltantes dependen de otras variables.

      - **MNAR (Missing Not at Random)**: Los valores faltantes dependen de la propia variable con valores ausentes.

      Usando herramientas de visualización como **Missingno** y análisis estadístico, puedes descubrir estos patrones.

      ### 6. **Funciones adicionales de pyjanitor**:

      pyjanitor expande las capacidades de pandas con funciones específicas para limpieza, incluidas aquellas que exponen valores faltantes implícitos:

      ```python

      import janitor

      df = df.complete()

      ```

      Puedes utilizar janitor para completar los valores implícitos y exponer relaciones entre variables.

      ### 7. **Uso de máscaras para filtrar y analizar valores faltantes**:

      Puedes utilizar máscaras booleanas para filtrar filas y columnas con valores faltantes y hacer un análisis más detallado.

      ```python

      missing_mask = df.isnull()

      missing_columns = df.columns[missing_mask.any()]

      ```

      ### Conclusión

      Ampliar tu conjunto de herramientas para manejar valores faltantes implica una combinación de **visualización**, **análisis estadístico** y **métodos de imputación** avanzados. Utilizar bibliotecas como **Seaborn**, **Missingno**, **pyjanitor**, junto con las funciones integradas de **Pandas**, te permitirá explorar los datos de manera más efectiva y tomar decisiones informadas sobre cómo manejar valores faltantes.

      Este es mi código del reto, funcional en Notebook, teniendo en cuenta que faltarían modificaciones ya que aún no se ha registrado como un accessor de DataFrame y no tiene acceso directo a self._obj.

      def missing_mosaic_plot( self, categorical_variable_1: str, categorical_variable_2: str, missing_data_variable, str, ): fig, ax = plt.subplots(figsize = (15, 10)) ( self .select_columns(f"{missing_data_variable}", f"{categorical_variable_1}", f"{categorical_variable_2}") .assign( weight = lambda df : df[f"{missing_data_variable}"].isna().replace([True, False], ["NA", "¡NA"]) ) .groupby( [f"{categorical_variable_1}", f"{categorical_variable_2}", f"{missing_data_variable}"], dropna = False, as_index = True ) .size() .pipe( lambda df : mosaic( data = df, properties = lambda key : {"color":"r" if "NA" in key else "gray"}, horizontal = True, axes_label = True, title = " ", labelizer = lambda key: " ", ax = ax ) ) ) ;

      Muy interesante el Grafico de Mosaico. Nos permite visualizar datos categoricos multivariantes de forma precisa e informativa.

      Aca mi humilde aporte:

      def create_mosaic_plot(df, var1, var2, var3, figsize=(10,10)): """ Crea un diagrama de mosaico para visualizar la relación entre tres variables, resaltando los valores faltantes. Parámetros: ----------- df : pandas.DataFrame DataFrame de entrada var1 : str Primera variable (se usará para agrupar) var2 : str Segunda variable (se usará para agrupar) var3 : str Tercera variable para verificar valores faltantes figsize : tuple, opcional Tamaño de la figura, por defecto es (10,10) Retorna: -------- matplotlib.figure.Figure La figura creada """ fig, ax = plt.subplots(figsize=figsize) (df.select_columns(var1, var2, var3) .assign( var3 = lambda df: df[var3].isna().replace({True: "NA", False: "!NA"}) ) .groupby( [var1, var2, "var3"], dropna=False, as_index=True ) .size() .pipe( lambda df: mosaic( data=df, properties=lambda key: {"color": "r" if "NA" in key else "gray"}, horizontal=True, axes_label=True, labelizer=lambda key: "", ax=ax ) ) ) return fig create_mosaic_plot(nhanes_df, "gender", "general_health_condition", "weight")

      Esta fue mi clase más difícil en toda mi carrera, no por otra cosa si no porque no estaba haciendo la codificación correctamente y la documentación ni la IA eran de ayuda. Lo que me hizo alejarme un mes de todo esto (después de varios meses de intenso estudio). Hoy por fin logré progresar.

      Si algo puedo dejar a los que pasen por aquí, es que no se rindan, aún si cometieron el error de alejarse de todo tanto tiempo como yo, siempre es posible corregir nuestros errores aunque tengamos que pagar el precio (en mi caso haber perdido tiempo y lo que este cuesta).

      pandas.DataFrame.groupby

      dropna: bool, default True

      as_index: bool, default True

      Clase 04 - Tratamiento de datos faltantes

      https://www.youtube.com/watch?v=NtAX81IuiNY Universidad de Buenos Aires