Los Microcontroladores poseen entradas y salidas pero no tanta capacidad de procesamiento. Lo que se hace normalmente es que tengan acceso a internet para usar su capacidad de conectividad y no tanto su memoria.

Por otro lado, la Raspberry Pi tiene más capacidad de procesamiento y memoria. Su funcionamiento es más complejo. Depende de tu proyecto puedes usar arquitecturas maestro - esclavo o solamente tu Raspberry Pi.